
Das Format ist intern in so genannte Boxes strukturiert. Boxes sind Einheiten in der Datei mit jeweils spezifischen Informationen. Die Grundstruktur enthält drei Boxes:
Grundstruktur einer JPEG2000-Datei
Die Signature Box wird zu Identifizierung der Datei benötigt, die Header Box enthält alle wichtigen Informationen zum Bild wie z.B. Farbdefinition, Verfasser, lizenzrechtliche Hinweise. Die Contiguous Codestream Box enthält die komprimierten Bilddaten.