After Effects bietet die Möglichkeit die erstellten Kompositionen untereinander zu verschachteln.

Gründe um Kompositionen zu verschachteln:
a. um bei aufwendigen Projekten den nötigen Überblick zu bewahren.
b. um einer ganzen Gruppe von Ebenen Transformations - Änderungen oder Effekte zuzuweisen.
c. um Stellvertreter zu erstellen: bei aufwendigen, renderintensiven Projekten ist es sinnvoll einzelne Elemente (z.B den Hintergrund) in eine eigene Komposition zu erstellen und diesen als Stellvertreter zu rendern.

Das Flußdiagramm macht das Verschachteln der Kompositionen deutlich.

Unter VOREINSTELLUNGEN / ALLGEMEIN / ZEIT ALLER ZUSAMMENGEHÖRIGEN ELEMENTE SYNCRONISIEREN kann festgelegt werden, das bei einer Änderung des aktuellen Zeitpunktes in einer Komposition, die Zeit in den verschachtelten Kompositionen auch geändert wird. VORSICHT: kann bei aufwendigen Projekten zu Programm Abstürzen führen.

In der Videoschulung wird das Verschachteln am Projekt "Verschachteln01.aep" erklärt. Dieses kann zum besseren Verständnis heruntergeladen werden.